Ketua Departemen
Dr. Majariana Krisanti, S.Pi, M.Si

Sekretaris Departemen 
Dr. Ali Mashar, S.Pi, M.Si

Kepala Divisi Produktifitas dan Lingkungan Perairan
Prof. Dr. Ir. Kadarwan Soewardi

Kepala Divisi Ekobiologi dan Konservasi Sumberdaya Perairan
Prof. Dr. Ir. M.F. Rahardjo, DEA

Kepala Divisi Manajemen Sumberdaya Perikanan
Prof. Dr. Ir. Mennofatria Boer, DEA

Komisi Pendidikan Sarjana
Manajemen Sumberdaya Perairan
Ketua  Dr. Ir. Niken TM. Pratiwi, M.Si
Wakil : Dr. Ir. Rahmat Kurnia, M.Si

Ketua Program Studi S2
Pengelolaan Sumberdaya Pesisir dan Lautan
Dr. Ir. Zairion, M.Sc

Ketua Program Studi S2
Pengelolaan Sumberdaya Perairan
Dr. Ir. M. Mukhlis Kamal, M.Sc

Ketua Program Studi S3
Pengelolaan Sumberdaya Pesisir dan Lautan
Dr. Ir. Fredinan Yulianda, M.Sc

Ketua Program Studi S3
Pengelolaan Sumberdaya Perairan
Dr. Ir. Sigid Hariyadi, M.Sc

Komisi Kemahasiswaan dan Disiplin
Ketua :
Aliati Iswantari, S.Pi., M.Si
Anggota : Dr. Ir. Gatot Yulianto, M.Si 

Unsur Penunjang Pelaksana Administrasi :

Kepala Tata Usaha
Mery Rusmini, SE

Pengelola Keuangan Unit
Suryanti

Pengadministrasi Kepegawaian
Ari Maria, SM

Pengadministrasi Pendidikan
Akademik S1 MSP : Alia Kuswardana, SE
Akademik S2/S3 PS-SPL : Widaryanti, S.Pi, MM
Akademik S2/S3 PS-SDP : Siti Rokiah, SM

Pengadministrasi Umum
Maryani, SM
Unus Supriatna
Aji

Pengadministrasi Sarana dan Prasarana
KMS Zainal Abidin

Teknisi Sarana dan Prasarana  (Jaringan dan Komputer)
Haris Munandar, S.Kom

Teknisi Sarana dan Prasarana  (Listrik)
Aji Permana

Teknisi Lab. Produktifitas dan Lingkungan Perairan
Yayat Supriatna
Siti Nursiyamah
Heri Hermawan
Reza Zulmi, S.Pi, M.Si
Adon

Teknisi Lab. Ekobiologi dan Konservasi Sumberdaya Perairan
Aries Asriansyah, S.Pi
Sukartina

Teknisi Lab. Manajemen Sumberdaya Perikanan
Siti Nuraeni

Pramu Kantor
Dewi Sinta
Sumardi
Anisa

Pengemudi
Rudi Hilman